Comparação de três tampões para extração de DNA genômico de tecidos foliares de <em>Eucalyptus camaldulensis</em> Dehnh
DOI:
https://doi.org/10.20435/multi.v0i48.152Keywords:
análises moleculares, CTAB, proteinase K.Abstract
A obtenção de DNA genômico de qualidade e em quantidade suficiente é o primeiro passo para o desenvolvimento das diversas técnicas moleculares que avaliam o polimorfismo em sua sequência. A presença de fenóis, polissacarídeos e de outros componentes representa o principal problema na extração de DNA e na aplicação subsequente, restringindo a eficiência do processo. Este trabalho tem como objetivo comparar três tampões de extração de DNA genômico de folhas jovens, maduras de Eucalyptus camaldulensis, e para tanto se utilizou o protocolo CTAB (brometo de cetiltrimetilamônio) com as seguintes modificações: Tampão 1, seguiu-se a descrição do protocolo, sem alterações; Tampão 2, ao protocolo, adicionou-se 2% de PVP (20 ug mL-1 do tampão de extração); Tampão 3, ao protocolo, adicionou-se 2% de PVP (20 ug mL-1 do tampão de extração) e 50 uL de Proteinase K (20 ug mL-1 do tampão de extração). A quantificação do DNA total foi realizada de três formas, eletroforese em gel de agarose [0,8%], espectrofotômetro Biospectro SP-220®, e em nano-espectrofotômetro quantificador. De maneira geral, o protocolo de extração com suas modificações permitiu a obtenção de quantidades satisfatórias e de boa qualidade de DNA, visualizadas primeiramente pelas imagens no gel de agarose, e confirmadas pela concentração calculada por absorbância nos outros dois métodos, contudo os tampões 1 e 2 proporcionaram os melhores resultados quantitativos e qualitativos.
References
ALFENAS, A. C. Eletroforese e marcadores bioquímicos em plantas e microorganismos. 2. ed. Viçosa, MG: Ed. UFV, 2006. 627p.
ANGEL, R.; CLAUS, P.; CONRAD, R. Methanogenic archaea are globally ubiquitous in aerated soils and become active under wet anoxic conditions. The ISME Journal, v. 6, p. 847-62, 2012.
BERED, F.; BARBOSA NETO, J. F.; CARVALHO, F. I. F. Marcadores moleculares e sua aplicação no melhoramento genético de plantas. Ciência Rural, Santa Maria, RS, v. 27, n. 3, ago. 1997.
BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; GRATTAPAGLIA, D. Manual prático para o desenvolvimento de marcadores microssatélites em plantas. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2007. 111p.
Campos, T.; Oblessuc, P. R.; Sforça, D. A.; Cardoso, J. M. K.; Baroni, R. M.; Sousa, A. C. B.; Carbonell, S. A. M.; Chioratto, A. F.; Garcia, A. A. F.; Rubiano, L. B. Inheritance of growth habit detected by genetic linkage analysis using microsatellites in the common bean (Phaseolus vulgaris L.). Molecular Breeding, v. 27, n. 4, p. 549-60, 2010.
DEMEK, T.; ADAMS, R. P. The effects of plant polysaccharides and buffer additives on PCR. Biotecnologia, v. 12, n. 3, p. 333-4, 1992.
DOYLE, J. J.; DOYLE, J. L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, v. 12, p. 13-15. 1990.
FALEIRO, F. G.; BARROS, E. G.; VILARINHOS, A. D.; CORRÊA, R. X.; PAULA JÚNIOR, T. J.; MOREIRA, M. A. Otimização da extração de DNA de esporos de Uromyces appendiculatus. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 21, n. 2, p. 304-307, jun. 1996.
FALEIRO, F. G.; FALEIRO, A. S. G.; CORDEIRO, M. C. R.; KARIA, C. T. Metodologia para operacionalizar a extração de DNA de espécies nativas do cerrado visando a análises moleculares. Comunicado Técnico, 92. Planaltina, DF: EMBRAPA CERRADOS, abr. 2003.
FERES, F.; SOUZA, A. P.; AMARAL, M. C. E.; BITTRICH, V. Avaliação de métodos de preservação de amostras de plantas de savanas neotropicais para a obtenção de DNA de alta qualidade para estudos moleculares. Revista Brasileira de Botânica, São Paulo, v. 28, n. 2, jun. 2005.
FERREIRA, M. E.; GRATTAPAGLIA, D. Introducción al uso de marcadores moleculares en el análisis genético. 1. ed. Brasília: EMBRAPA-CENARGEN, 1998. 220p.
GOLLE, D. P.; REINIGER, L. R. S.; CURTI, A. R.; BEVILACQUA, C. B. Melhoramento florestal: ênfase na aplicação da biotecnologia. Ciência Rural, Santa Maria, RS, v. 39, n. 5, p. 1606-13, ago. 2009.
HARBONE, J. B.; PALO, R. T.; ROBBINS, C. T. Plant defenses against mammalian herbivore. Boca Raton: CRC Press LLC, 1991. 192p.
LIMA, R. S. N.; LEÃO, P. C. S.; SANTOS, C. A. F. Quantificação e Pureza do DNA de Videira por Meio de Espectrofotometria. JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 1., 2006, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2006. p. 219-223.
MAZZA, M. C. M; BITTENCOURT. V. M. 12. Extração de DNA de tecido vegetal de Araucaria angustifólia (Araucariaceae). Boletim de Pesquisas Florestais, Colombo, PR, n. 41, p. 12-17, jul./dez. 2000.
MURRAY, M. G.; THOMPSON, W. F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acids Research, n. 8, p. 4321-5, 1980.
NAGARAJAN, S.; STEEPHEN, K. M.; NAIR, R. R.; SETHURAMAN, T.; ALAGAR, P.; GANESH, D. Improved protocol for isolation of genomic DNA from leaf tissues os Phyllanthus emblica Gaertn. Iranian Journal of Biotechnology, v. 9, n. 4, out. 2011.
PANDEY, V. N. et al. Role of methionine 184 of human immunodeficiency virus type-1 reverse transcriptase in the polymerase function and fidelity of DNA synthesis. Biochemistry, 35(7): 2168-2179, 1996.
QUEIROZ, C. R. A. A.; MORAIS, S. A. L.; NASCIMENTO, E. A. Caracterização dos taninos da aroeira-preta (Myracrodruon urundeuva). Revista Árvore, v. 26, n. 4, p. 485-492, 2002.
Santalla, M.; De Ron, A. M.; De La Fuente, M. Integration of genome and phenotypic scanning gives evidence of genetic structure in Mesoamerican common bean (Phaseolus vulgaris L.) landraces from the southwest of Europe. Theoretical and Applied Genetics, v. 120, n. 8, p. 1635-51, maio 2010.
SHI, S.R.; DATAR, R.; LIU, C.; WU, L.; ZHANG, Z.; COTE, R.J.; TAYLOR, C.R. DNA extraction from archival formalin-fixed, paraffin-embedded tissues: heat-induced retrieval in alkaline solution. Histochem Cell Biology, Los Angeles, v. 122, n. 3, p. 211-8. 2004.
TURNER, P. C.; MCLENNAN, A. G.; BATES, A. D.; WHITE, M. R. H. Instants notes in molecular biology. Guildford Biddles, UK: [s.n.], 1997. 307p.
VITAL, B. R.; CARNEIRO, A. C. O.; PIMENTA, A. S.; DELLA LUCIA, R. M. Adesivos à base de taninos das cascas de duas espécies de eucalipto para produção de chapas de flocos. Revista Árvore, v. 28, n. 4, p. 571-82, 2004.
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
Os artigos publicados na Revista Multitemas têm acesso aberto (Open Access) sob a licença Creative Commons Attribution, que permite uso, distribuição e reprodução em qualquer meio, sem restrições desde que o trabalho original seja corretamente citado.
Direitos Autorais para artigos publicados nesta revista são do autor, com direitos de primeira publicação para a revista. Em virtude de aparecerem nesta revista de acesso público, os artigos são de uso gratuito, com atribuições próprias, em aplicações educacionais e não-comerciais.